Anotacao De Genoma
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1. Anotação genômica e caracterização de locos microssatélites em sequências expressas do genoma do camarão marinho Litopenaeus vannamei
Litopenaeus vannamei é conhecido como camarão branco do Pacífico e é a principal espécie de peneídeo comercializada no mundo. Sua distribuição geográfica compreende a costa do Oceano Pacífico, indo desde o México até o Peru. Devido a sua relevante importância econômica, esta espécie passou a ser cultivada, adaptando-se bem às condições de c
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 27/05/2011
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2. Anotação do transcriptoma parcial de Anopheles (Nyssorhynchus) darlingi Root, 1926
Insetos transmissores de doenças têm sido estudados para caracterização de diversos aspectos biológicos e evolutivos. Sequenciamentos de genomas inteiros têm permitido comparações entre sequências gênicas de espécies diferentes, fornecendo dados moleculares. Citam-se os mosquitos Anopheles gambiae (subfamília Anophelinae), principal vetor da mal�
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 08/04/2011
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3. Caracterização molecular do gene phoP de Corynebacterium pseudotuberculosis e avaliação do potencial vacinal da linhagem PhoP mutante / Molecular characterization of the PhoP gene of Corynebacterium pseudotuberculosis and evaluation of potential vaccine strain PhoP mutant
Corynebacterium pseudotuberculosis é o agente etiológico da linfadenite caseosa (LC), uma enfermidade crônica contagiosa que acomete pequenos ruminantes e acarreta sérias perdas econômicas para a ovinocaprinocultura. Apesar da prevalência mundial da LC e das intensas pesquisas em torno deste microorganismo ainda não existem métodos diagnósticos e pr
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 18/03/2011
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4. Schistosome serine protease inhibitors: parasite defense or homeostasis?
Serpinas são uma família de inibidores macromoleculares estruturalmente conservados encontrados em inúmeros sistemas biológicos. O término e a anotação dos genomas de Schistosoma mansoni e de Schistosoma japonicum permitiram a identificação por análise filogenética de dois principais clados de serpinas. S. mansoni mostra uma multiplicidade maior d
Anais da Academia Brasileira de Ciências. Publicado em: 2011-06
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5. Anotação funcional de sequências com BLAST2GO.
2010
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo. Publicado em: 2011
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6. Genômica estrutural de Musa acuminata ssp. burmannicoides var. Calcutta 4.
O projeto de pesquisa intitulado "Análise da Estrutura Primária do Genoma A de Musa acuminata", financiado pelo Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPq), e executado pela Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, em parceria com a Universidade Católica de Brasília (UCB) e o Centro Francês de Pesquisa Agrícola para o Desenvolvimento Int
Brasília. Publicado em: 2011
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7. Genômica e proteômica de Anaplasma marginale: contribuições para o controle da riquétsia.
A anaplasmose bovina é causada pela riquétsia intra-eritrocítica Anaplasma marginale, responsável por importantes prejuízos econômicos, por causa da alta morbidade e mortalidade em rebanhos bovinos suscetíveis. A vacinação tem sido uma forma econômica e eficiente de controlar a enfermidade. No entanto, os métodos de imunização tradicionais apres
SÉRIES Embrapa: [coletânea de publicações seriadas da Embrapa Gado de Corte - 2006 - 2007 -2008]. Campo Grande. Publicado em: 2011
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8. Análise proteômica diferencial da fração periplasmática de Xanthomonas citri subsp. citri: proteínas relacionadas com a indução da patogenicidade in vitro
O cancro cítrico é uma doença economicamente importante para a citricultura, não existindo atualmente medidas preventivas e curativas eficazes para combatê-la. Os agentes etiológicos são bactérias do gênero Xanthomonas, classificadas em duas espécies, X. citri e X. fuscans. A variedade mais agressiva aos citros é a bactéria X. citri subsp. citri
Publicado em: 2010
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9. Identificação, classificação e anotação de enzimas desubiquitinadoras e ubiquitina-símile em Trypanosoma cruzi
O sequenciamento do genoma de Leishmania major, Trypanosoma cruzi e T. brucei mostrou que cada genoma contém entre 8300-1200 genes que codificam proteínas, dos quais aproximadamente 6500 são comuns entre estas espécies. Neste estudo nós focamos a busca nos bancos de dados de tripanossomatídeos por proteínas envolvidas com o metabolismo de ubiquitina.
Publicado em: 2009
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10. Computational methods applied to the genomes of the mycobacteria and trypanosomatids: of the assembly to the notation. / Abordagens computacionais aplicadas aos genomas de micobactérias e Trypanossomatídeos : da montagem à anotação.
Esta dissertação trata do desenvolvimento de novas abordagens e ferramentas computacionais focadas nas seguintes aplicações: aperfeiçoamento do fluxo de informação de Plataformas Tecnológicas de Seqüenciamento e de Bioinformática; montagem de seqüências em projetos genomas; detecção de seqüências repetitivas; análise comparativa e anotação
Publicado em: 2008
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11. Gerenciamento de anotações de biosseqüências utilizando associações entre ontologias e esquemas XML
A Bioinformática é uma área da ciência que visa suprir pesquisas de genomas com ferramentas computacionais que permitam o seu desenvolvimento tecnológico. Dentre essas ferramentas estão os ambientes de anotação e os Sistemas Gerenciadores de Bancos de Dados (SGBDs) que, associados a ontologias, permitem a formalização de conceitos do domínio e tam
Publicado em: 2008
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12. Um sistema baseado em agentes para re-anotação de genomas / An agent-based system for re-annotation of genomes
A análise da informação contida em seqüências genéticas tem ganho cada vez mais importância nos dias atuais. A chamada anotação genética tem o objetivo de, a partir de uma ou mais seqüências, determinar suas características estruturais e funcionais. Muitos processos de anotação já foram realizados com êxito aumentando consideravelmente nosso
Publicado em: 2007