A função dos motivos léxicos na organização do 5S rRNAs de Actinomicetes
AUTOR(ES)
Rodrigues-Subacius, Sandra M, Padilla, Gabriel
FONTE
Brazilian Journal of Microbiology
DATA DE PUBLICAÇÃO
2007-09
RESUMO
Neste trabalho são apresentados resultados obtidos empleando o método linguístico para identificar sítios no 5S rRNAs de actinomicetes com significado biológico. A abordagem identificou palavras-tripletes, junto com a sequência de bases do 5S rRNAs, localizados principalmente nos domínios alfa e beta da estrutura secundária. Entre eles, existem palavras-tripletes que representam sítios de ligação de proteínas universais, que incluem importantes assinaturas procarióticas, além de sítios estrategicamente colocados em regiões críticas relacionados com a formação do complexo 5S ribonucleoproteína (RNP). Nestes sítios, onde a pressão GC promove substituições, as alterações não afetaram seu significado biológico. Sítios formados por GGY (ou mais raramente GER), jogam um papel importante como receptores de proteínas ribossomicas rpL18 e rpL5. Os dados também sugerem que ao contrário de aumentar a variabilidade molecular, esperada pela diversidade em espécies e habitats ocupados pelo grupo, GC funciona como um mecanismo para diversidade inter-específica.
ASSUNTO(S)
actinomicetes 5s rrna pressão gc análise linguístico motivos léxicos
Documentos Relacionados
- Nucleotide sequences of 5S rRNAs from four jellyfishes.
- The nucleotide sequences of 5S rRNAs from three ciliated protozoa.
- Heterogeneity in the 3'-portion of Papilionaceae 5S rRNAs. The primary structure of alfalfa 5S rRNA.
- Secondary structure and phylogeny of Staphylococcus and Micrococcus 5S rRNAs.
- The nucleotide sequences of 5S rRNAs from two ribbon worms: Emplectonema gracile contains two 5S rRNA species differing considerably in their sequences.