Estudo in silico dos domÃnios protÃicos presentes em uma amostra de 86 clusters de Leishmania chagasi

AUTOR(ES)
DATA DE PUBLICAÇÃO

2005

RESUMO

A Leishmania chagasi, um parasita protozoÃrio, à o agente etiolÃgico da Leishmaniose visceral nas AmÃricas. Foi realizado um estudo do transcriptoma desse organismo utilizando-se 17.921 etiquetas de genes expressos (ESTs) gerados a partir de uma biblioteca de cDNA de promastigota. A montagem de todas as seqÃÃncias utilizando o CAP3 resultou em 1.449 clusters (utilizando 49% dos ESTs). Aproximadamente 35% dos clusters apresentaram similaridade com alguma seqÃÃncia depositada em bancos pÃblicos. As categorias funcionais mais representadas no transcriptoma foram as dos clusters que tiveram anotaÃÃo para genes que codificam proteÃnas ribossomais e de transporte, assim como os que tiveram similaridade com genes envolvidos em processos de modificaÃÃo pÃs-traducional e renovaÃÃo de proteÃnas. De uma amostra de 86 clusters anotados para funÃÃes conhecidas ou hipotÃticas, foram identificados 79 domÃnios utilizando os bancos disponÃveis no CDD e no Interpro. A maioria desses domÃnios està previamente descrita tanto em proteÃnas de eucariotos quanto nas de procariotos. Os domÃnios nunca descritos para outros Kinetoplastida estÃo representados entre diferentes classes nos 5 reinos. Adicionalmente, uma interface web com os resultados e a metodologia adotada no presente trabalho foi construÃda e disponibilizada. Os resultados contribuÃram para uma melhor compreensÃo dos mecanismos de controle de expressÃo, da interaÃÃo parasita-hospedeiro, da resistÃncia à drogas e da suscetibilidade e de outros importantes questionamentos biolÃgicos sobre a leishmaniose e doenÃas parasitÃrias correlatas

ASSUNTO(S)

genetica leishmania chagasi â taxonomia e genÃtica genÃmica genÃtica leishmaniose visceral â histÃrico e epidemiologia biologia molecular bioinformÃtica â domÃnios protÃicos â banco e mineraÃÃo de dados

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