Production of DNA microarray and expression analysis of genes from Xylella fastidiosa in different culture media

AUTOR(ES)

Travensolo, Regiane de Fátima, Costa, Maria Vitória Cecchette Gottardi, Carareto-Alves, Lucia Maria, Carrilho, Emanuel, Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo

FONTE

Brazilian Archives of Biology and Technology

DATA DE PUBLICAÇÃO

2009-06

RESUMO

DNA Microarray foi desenvolvida para monitorar a expressão de muitos genes de Xylella fastidiosa, permitindo a comparação de duas situações distintas em um único experimento. Os experimentos foram feitos utilizando células de X. fastidiosa cultivada em dois meios de cultura: BCYE e XDM2. Pares de oligonucleotídeos iniciadores foram sintetizados, depositados em lâminas de vidro e o arranjo foi hibridizado contra cDNAs marcados fluorescentemente. Os sinais emitidos foram quantificados, normalizados e os dados foram estatisticamente analisados para verificar os genes diferencialmente expressos. De acordo com nossos dados, 104 genes foram diferencialmente expressos para o meio de cultura XDM2 e 30 genes para o BCYE. No presente estudo, nós demonstramos que a técnica de DNA microarrays eficientemente diferencia genes expressos sob diferentes condições de cultivo.

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