Uso de marcadores SNPs em Arachis para mapeamento de genes candidatos e análise de sintenia genômica

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DATA DE PUBLICAÇÃO

2008

RESUMO

O desenvolvimento de mapas de ligação é fundamental para estudos genéticos de plantas. Para o amendoim cultivado, entretanto, os baixos níveis de polimorfismo molecular dificultam a obtenção de mapas de ligação úteis. Uma opção é a utilização de espécies silvestres de Arachis, que possuem maior polimorfismo molecular, e são ricas em alelos que conferem características de interesse, como genes de resistência a doenças. O amendoim cultivado é tetraplóide com genoma AABB, já a maioria das espécies silvestres são diplóides com genomas do tipo AA ou BB. Estudos com parentes silvestres diplóides do amendoim facilitam os estudos da genética do amendoim e permitem a identificação de alelos silvestres freqüentemente associados a resistências. Recentemente dois mapas diplóides, AA e BB, foram construídos incluindo cruzamentos com os prováveis ancestrais silvestres do amendoim e espécies afins. Como os genomas AA e BB são evolutivamente próximos, é esperado que haja sintenia entre os marcadores e os genes em ambos os genomas. Desta forma, uma vez alinhados os mapas, é possível transferir informações entre eles, acrescentando assim dados importantes aos dois mapas. O presente trabalho foi divido em dois capítulos, no primeiro é apresentado o desenvolvimento e a utilização de marcadores polimórficos em uma única base (SNPs) para seqüências candidatos a genes de resistência a doenças (RGA) em Arachis, onde, dezessete marcadores análogos a genes de resistência foram desenvolvidos e mapeados no genoma AA de Arachis. Estes tenderam a mapear agrupados e alguns posicionaram próximos a regiões de QTLs para resistência a mancha preta. No segundo capítulo é apresentado o alinhamento dos mapas genéticos AA e BB de Arachis, onde foram escolhidos marcadores gênicos de cópia única (marcadores leg.) com posições estratégicas no mapa AA, para transferência para o mapa BB. Dezesseis marcadores legs foram desenvolvidos, dos quais 10 mapearam em seis grupos de ligação diferentes. O alinhamento dos mapas AA e BB revelam alto grau de sintenia entre os dois genomas, com poucas recombinações, desde a divergência dos genomas.

ASSUNTO(S)

snp genetic mapping arachis genética vegetal; amendoim; genomas mapeamento genético arachis snp rga genetica vegetal rga

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