Genomas In Silico
Mostrando 1-12 de 12 artigos, teses e dissertações.
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1. Análises in silico da filogenia e do perfil de genes associados à virulência, dos genomas de linhagens de Escherichia coli de origem aviária
As infecções causadas por linhagens de Escherichia coli de origem aviária (APEC) são responsáveis por perdas significativas na indústria avícola em todo mundo. Risco zoonótico tem sido atribuído às linhagens APEC, devido às semelhanças existentes entre elas e linhagens de E. coli patogênicas extraintestinais (ExPEC) de origem humana, causadoras
Pesq. Vet. Bras.. Publicado em: 2014-02
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2. Anotação do transcriptoma parcial de Anopheles (Nyssorhynchus) darlingi Root, 1926
Insetos transmissores de doenças têm sido estudados para caracterização de diversos aspectos biológicos e evolutivos. Sequenciamentos de genomas inteiros têm permitido comparações entre sequências gênicas de espécies diferentes, fornecendo dados moleculares. Citam-se os mosquitos Anopheles gambiae (subfamília Anophelinae), principal vetor da mal�
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 08/04/2011
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3. Identificação e análise de sequências codificantes com atributos conflitantes em genomas procariotos / Analysis and identification of prokaryotic coding sequences with confliting atributes eng
The advent of new sequencing technologies and the development of computational tools that facilitate the analysis of genomes, generated the exponential growth of genome databases. New approaches in-silico of the comparative genomics use such data in its comparisons. Nevertheless, recent work on the genome of Escherichia coli indicate that the current state o
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 23/08/2010
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4. Caracterização da sinal-peptidase I de Mycoplasma hyopneumoniae
Mycoplasma hyopneumoniae é uma bactéria pertencente à classe Mollicutes, sendo o agente etiológico da pneumonia enzoótica suína e o agente primário do complexo de doenças respiratórias de suínos (CDRS). A sinal-peptidase I (SPase I) é uma endopeptidase de membrana que cliva os peptídeos-sinal (PS) de proteínas transportadas pelo sistema geral de
Publicado em: 2010
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5. Identificação e Análise de Sequências Codificantes com Atributos Conflitantes em Genomas Procariotos / Analysis and Identification of Prokaryotic Coding Sequences With Conflicting Atributes
The advent of new sequencing technologies and the development of computational tools that facilitate the analysis of genomes, generated the exponential growth of genome databases. New approaches in-silico of the comparative genomics use such data in its comparisons. Nevertheless, recent work on the genome of Escherichia coli indicate that the current state o
Publicado em: 2010
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6. Identificação, classificação e anotação de enzimas desubiquitinadoras e ubiquitina-símile em Trypanosoma cruzi
O sequenciamento do genoma de Leishmania major, Trypanosoma cruzi e T. brucei mostrou que cada genoma contém entre 8300-1200 genes que codificam proteínas, dos quais aproximadamente 6500 são comuns entre estas espécies. Neste estudo nós focamos a busca nos bancos de dados de tripanossomatídeos por proteínas envolvidas com o metabolismo de ubiquitina.
Publicado em: 2009
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7. Computational methods applied to the genomes of the mycobacteria and trypanosomatids: of the assembly to the notation. / Abordagens computacionais aplicadas aos genomas de micobactérias e Trypanossomatídeos : da montagem à anotação.
Esta dissertação trata do desenvolvimento de novas abordagens e ferramentas computacionais focadas nas seguintes aplicações: aperfeiçoamento do fluxo de informação de Plataformas Tecnológicas de Seqüenciamento e de Bioinformática; montagem de seqüências em projetos genomas; detecção de seqüências repetitivas; análise comparativa e anotação
Publicado em: 2008
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8. In silico analysis of integrases in the phytopathogen Xylella fastidiosa: diversity, integration sites and association with bacteriophages. / Análise in-silico de integrases no fitopatógeno Xylella fastidiosa: diversidade, sítios de integração e associação com bacteriófagos.
Os elementos genéticos móveis encontrados no genoma da bactéria Xylella fastidiosa (Xf) são representados principalmente por bacteriófagos (na forma de profagos inseridos no genoma) e ilhas genômicas. As integrases são responsáveis pelo processo de mobilização (integração e/ou excisão) destes elementos, através do mecanismo de recombinação s�
Publicado em: 2008
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9. Evolução dos Errantivirus gtwin e gypsy no gênero Drosophila
Errantivirus compreende um grupo monofilético de retrotransposons com LTRs de insetos, caracterizados pela presença do gene env em adição aos genes gag e pol. Nos retrovírus a proteína Env é responsável pela sua infecciosidade, causando a fusão do vírion com a membrana da célula. Dados recentes sugerem que os Errantivirus se originaram a partir de
Publicado em: 2008
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10. Analysis of copia transposable element in Drosophila species / Análise do Elemento Transponível copia em Espécies de Drosophila
Transposable elements (TEs) are segments of DNA that have the ability to move up and replicate themselves within the genome. The retrotransposon copia belongs to the superfamily copia and was first sequenced in D. melanogaster. We used in part of this work, which corresponded to a populational analysis of element copia in the genomes of species of the group
Publicado em: 2008
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11. Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcriÃÃo responsivos Ãseca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz
Abiotic stresses are the most responsable for causing changes in plant growth and development. The plants, in counterpart, make use of a variety of responses in order to maintain their metabolic and physiological processes. One of the main plants responses to environmental conditions alterations is the additional regulation of expression. Moreover, the biosy
Publicado em: 2007
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12. Identificação de etiquetas de seqüências expressas (ESTs) de Eucalytpus relacionadas a genes das vias controladoras do florescimento de Arabidopsis
As decisões envolvidas na iniciação do processo de florescimento dependem da expressão equilibrada de uma rede complexa de genes, que é regulada por fatores endógenos e ambientais. A regulação correta da transição para o florescimento é crucial para o sucesso reprodutivo das plantas; dessa forma elas desenvolveram mecanismos moleculares conservado
Brazilian Journal of Plant Physiology. Publicado em: 2005-06