Retrotransposons
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1. A re-annotation of the Anopheles darlingi mobilome
Abstract The mobilome, portion of the genome composed of transposable elements (TEs), of Anopheles darlingi was described together with the genome of this species. Here, this mobilome was revised using similarity and de novo search approaches. A total of 5.6% of the A. darlingi genome is derived of TEs. Class I gypsy and copia were the most abundant superfam
Genet. Mol. Biol.. Publicado em: 21/01/2019
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2. Evidence of ectopic recombination and a repeat-induced point (RIP) mutation in the genome of Sclerotinia sclerotiorum, the agent responsible for white mold
Abstract Two retrotransposons from the superfamilies Copia and Gypsy named as Copia-LTR_SS and Gypsy-LTR_SS, respectively, were identified in the genomic bank of Sclerotinia sclerotiorum. These transposable elements (TEs) contained direct and preserved long terminal repeats (LTR). Domains related to codified regions for gag protein, integrase, reverse transc
Genet. Mol. Biol.. Publicado em: 07/07/2016
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3. Citogenética comparativa em espécies de Hypostomus (Siluriformes, Loricariidae, Hypostominae) : contribuição da fração repetitiva do genoma para a diversidade cromossômica do grupo
Hypostomus is the widest genus of the armored catfishes in South America. This group presents a great diversity in color pattern and morphology, and shows not conservative chromosomal features. Different classes of repetitive DNAs have distinct evolutionary dynamics in the genome of eukaryotes. Therefore, analyses and distribution of these sequences in chrom
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 14/11/2012
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4. Caracterização e análise filogenética de retrotransposons LTR em três diferentes espécies de Arachis.
2006
ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA. Publicado em: 2011
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5. Genetic mapping of AFLP and retrotransposon-derived markers in sugarcane (Saccharum spp.) / Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.)
No presente trabalho, AFLPs e marcadores baseados em retrotransposons foram utilizados para a construção de um mapa de ligação integrado em cana-de-açúcar. Dois retrotransposons encontrados no genoma da cana-de-açúcar, denominados SURE e Garapa, foram estudados. Os princípios da técnica NBS-profiling foram usados para gerar marcadores direcionados
Publicado em: 2010
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6. Efeito de candidatos a supressores de silenciamento gênico viral em expressão de proteína recombinate em plantas
The aim of this work was to increase the efficiency of transient heterolog protein expression system using viral gene-silencing suppressors and Agrobacterium integrated. The use of plants as bioreactor is a promising strategy for large scale production of the heterolog protein. However, the use of genetically modified plants may lead to low protein expressio
Publicado em: 2010
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7. Avaliação in silico do transcriptoma do café : identificação de SNPs e inferência de mecanismos de regulação da expressão gênica / In silico analysis of the coffee transcriptome : identification of SNPs and inference of mechanisms of gene expression regulation
Coffee is one of the most important crops in the world, being worldwide consumed and having significant participation in under development economies. Coffea arabica and Coffea canephora are responsible for 70% and 30% of commercial production, respectively. Cytogenetic analysis established that C. arabica is an autogamous alotetraploid formed by a recent (1
Publicado em: 2010
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8. Mutations in retrotransposon AtCOPIA4 compromises resistance to Hyaloperonospora parasitica in Arabidopsis thaliana
Retrotransposons (RTEs) are a principal component of most eukaryotic genomes, representing 50%-80% of some grass genomes. RTE sequences have been shown to be preferentially present in disease resistance gene clusters in plants. Arabidopsis thaliana has over 1,600 annotated RTE sequences and 56 of these appear to be expressed because of the exact expressed se
Genetics and Molecular Biology. Publicado em: 11/12/2009
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9. SURE e Garapa: caracterização molecular e distribuição de dois retrotransposons com LTR em cana-de-açúcar. / SURE and Garapa: molecular characterization and distribution of two LTR retrotransposons in sugarcane.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar uma nova família de retrotransposons Copia em cana-de-açúcar, e também compreender a diversidade de retrotransposons com LTR transcricionalmente ativos em cana, com base na análise filogenética de cDNAs provenientes do projeto SUCEST. Foi assim isolada uma nova família de retrotransposons de cana, denominada
Publicado em: 2009
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10. Retrotransposon LTR no genoma de Moniliophthora perniciosa e Cochliobolus heterostrophus / LTR retrotransposon in the genome of Moniliophthora perniciosa and Cochliobolus heterostrophus
Retrotransposons do grupo Gypsy/Ty3 são os principais elementos transponíveis encontrados no genoma de fungos fitopatogênicos. Neste trabalho, dois retrotransposons denominados de MpSaci e Sophie foram analisados em Moniliophthora perniciosa e Cochliobolus heterostrophus, respectivamente. MpSaci foi utilizado para avaliar os marcadores moleculares baseado
Publicado em: 2009
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11. Desenvolvimento e validação de marcadores microssatélites para o feijão-comum / Development and validation of microsatellite markers for the common bean
O feijão-comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma cultura de destacada importância nutricional, econômica e social. Programas de melhoramento genético do feijoeiro têm utilizado marcadores moleculares como importantes ferramentas auxiliares em diversos tipos de estudos genéticos. Diferentes classes de marcadores têm sido desenvolvidas, dentre as quais se
Publicado em: 2009
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12. Analysis of copia transposable element in Drosophila species / Análise do Elemento Transponível copia em Espécies de Drosophila
Transposable elements (TEs) are segments of DNA that have the ability to move up and replicate themselves within the genome. The retrotransposon copia belongs to the superfamily copia and was first sequenced in D. melanogaster. We used in part of this work, which corresponded to a populational analysis of element copia in the genomes of species of the group
Publicado em: 2008